Akademia uczniowska to przedsięwzięcie, które Gimnazjum nr 1 realizuje pod patronatem Centrum Edukacji Obywatelskiej. Celem projektu jest zachęcenie uczniów do nauki przedmiotów matematyczno-przyrodniczych, co umożliwiają bardzo atrakcyjne formy zajęć. Nauczyciele, którzy wcześniej uczestniczyli w szkoleniach, prowadzą szkolne koła naukowe. Nie przekazują więc wiedzy w sposób teoretyczny, lecz angażują młodzież w prowadzenie eksperymentów, doświadczeń, obserwacji itp. W ten sposób uczniowie czują się prawdziwymi naukowcami i chętnie uczestniczą w zajęciach. 
Na tym nie koniec, bowiem wiedzę należy pomnażać. Intencją programu jest, aby każdy z uczestniczących w nim gimnazjalistów, wziął udział w zajęciach szkolnych kół naukowych oraz przeprowadził z innymi uczniami projekt wykorzystujący zdobytą wiedzę. 

Dzięki udziałowi w tym ogólnopolskim programie finansowanym ze środków Unii Europejskiej szkoła wzbogaciła się w mikroskop biologiczny z wbudowaną kamerą i z portem USB oraz odczynniki chemiczne. 
Tego typu zajęcia cieszą się dużą popularnością wśród uczniów. Wpływa też na to fakt, że w ramach projektu uczniowie wyjeżdżają (nieodpłatnie) na wycieczki edukacyjne np. do Kudyp nieopodal Olsztyna (zwiedzanie leśnego Arboretum Warmii i Mazur), Centrum Nauki Kopernik, muzeów, itp.